Genoomiline sekveneerimine võib muutuda leibkonna terminiks uue käsiseadmega

Anonim

Viie aasta jooksul võivad tarbijad hakata kasutama seadet, mis on väiksem kui klapp telefon, et jälgida õhku, testida nende toitu või diagnoosida, mis idu põhjustab maoärritust. Ja selle võimekuse juur näitab, mis nüüd on ainult teadlaste genoomide järjestus.

See on sõnum Ühendkuningriigi ja Kanada teadlaste meeskonnast, kes õpetavad kolleegiumi jaamas Texase A & M AgriLife Researchi nädalavahetusel klassi umbes 40 teadurit kogu USAst.

See kursus oli mingi täiskasvanutele mõeldud "täiskasvanute suvelaager", mis oli teistsugune, ütlesid korraldajad. Selle asemel, et õpetada genoomika ja bioinformaatika kunsti ja teadust mitme miljoni dollari varustuse puhul, mida tavaliselt on laborites, kasutas klass Oxford Nanopore Technology tehtud minions-a sekveneerimissüsteem. Põhimõtteliselt on see käes hoitav seade, kuhu proov asetatakse, ja seejärel mõne minuti jooksul proovi genoomi tõlgitakse ühe sülearvutiga.

"Selle süsteemi mobiilsus on selle seadme jaoks atraktiivne, " ütles dr John Tyson, Briti Columbia Ülikooli minionsõprade juhendaja ja uurija Vancouveris.

Seadet on juba kasutatud ebola kaotamiseks Guinea kauges džunglis ning proovide võtmiseks nii sääskede kui ka inimeste jaoks Zika viiruse esinemise kohta Brasiilia kirdeosas, vastavalt Birminghami ülikooli sõltumatute teadurite minioni juhendaja dr Nick Lomani Inglismaa.

Loman ütles, et teada saada, millised patogeenid on varakult esinenud, võib aidata teadlastel töötada rohkem järelevalves ja seega ennetuses, mitte reageerida probleemidele pärast probleemide tekkimist.

Vastavalt Colledge Station'i AgriLife Researchi Genomics ja Bioinformaatika teenistuse direktori dr Charlie Johnsoni sõnule on minion esindab tohutut hüpet teadlastele, kes vajavad väga kaasaskantavat süsteemi. Esiteks, palju uuringuid toimub kaugetes valdkondades, kus suuremaid seadmeid ei saa kasutada. Ja teiseks, mida kiiremini tulevad tulemused, seda kiiremini saab neid edasi viia.

"Sellist tüüpi kaasaskantav tehnoloogia ei asenda meie töömaja ettevõtte tasandil Illumina järjestuste süsteeme, mis 48 tunni jooksul võivad 48 inimese genoomi projektiga samaväärset teha, " ütles Johnson, märkides, et esimene inimese genoomi projekt võttis 13 aastat. "Pigem on minioni meie genoomika tööriistaribal veel üks suurepärane vahend."

"Selliste tehnoloogiate kasutamise õpetamine muudab teadusuuringute võimekuse, " ütles Johnson, kes osalesid koos Texas A & M veterinaarmeditsiini kooli dr Robert Burghardti ja Ashley Gustafsoniga. "250-le õpilastele on lihtsam õpetada, kuidas kasutada tehnoloogiat kui püüda seda projekti mitmel viisil käsitleda individuaalselt. Ja vähemalt põllumajanduses on meie lõppeesmärk inimkonna toitmine, seega aitab see kaasa selle avastamise poole."

Tõepoolest, kuigi seda tehnoloogiat võib lõpuks kasutada leibkonna tavapärase teabe kogumiseks, on uurimiskoht suures osas olnud põllumajandus, loodusvarad ja ravimid, märkis Johnson.

Tegelikult olid koolitusel osalenud teadlased kohustatud kasutama oma praeguste projektide tegelikke näidiseid tehnoloogia õppimise ajal. Segis sisalduvad lõvid, karud, kassid, Alaska jää südamikud, manateed ja erinevad putukad nagu kirbud ja skorpionid. Rääkige, kuidas need asjad räägivad, võib teadlasi lahendada.

"Me lihtsalt kriimustame pinda, " ütles dr. Mick Watson, minioni juhendaja ja genoomika juht, Edinburghi ülikool Šotimaal. "Tehnoloogia jõuab kohale, kus tarbijad saavad seda kasutada kolme kuni viie aasta jooksul."

Watson rõhutas ka seda, kui tähtis on põllumajandustootjatel kasutada põllumajandusettevõtetes odavat tehnoloogiat, et kindlaks teha patogeenide olemasolu, enne kui nad põllukultuuride ja kariloomade liigset kahjustamist põhjustavad.

See puudutab kiiret diagnoosimist, seega on võimalik tagada õige ravi ja see omakorda aeglustab pestitsiidide ja ravimi resistentsuse määra, ütles ta.

Loman nõustus.

"Sageli määrab arst välja üldise antibiootikumi, mis aitab teil end paremini tunda, teades, kas see on konkreetsetele bakteritele kõige tõhusam või kui tegelikult on see viirus, " ütles ta. "Võimalus kiiresti saada idu genoomse jada, mitte oodata kultuuri kasvatamiseks laboris, võib viia võime kasutada kitsamat spektrit antibiootikume, mis piiraks antibiootikumiresistentsuse kiirust."

Nimetatud meeskond on märkinud ka mõnevõrra rohkem tehnoloogialahenduse potentsiaalset kasutust, näiteks kvaliteedikontrolli käsitööõlid. Nädalavahetuskursuse järeldus oli Austinis Jester Kingi õlletehase väliskoht, mis boasts oma "loodusliku keskkonna ja kohaliku põllumajanduse" kasutamise. Seal uued varustatud üliõpilased teadlased ja meeskond kogusid pärmi proovid minions'ides käima. Watson selgitas, et teada, millised pärmid esinevad, võib aidata õlletehas teada, kuidas hallata selle sisu maitset.

menu
menu