Uued meetodid näitavad, kuidas Zika viirus omakorda omab rakke

6000 year/2000 AD Prophecy Disappointment (Juuli 2019).

Anonim

Teadlased on välja töötanud uue meetodi, mis võimaldab kindlaks teha, kuidas viirused interakteeruvad peremeesorganismi enda RNA-ga. Nagu ka ülevaade sellest, kuidas viirused suunavad peremeesrakku uute viirusosakeste tekitamiseks, võib tänapäeval loodusmeetodites avaldatud meetod võimaldada teadlastel disainida kunstmolekule, mis on võimelised blokeerima viiruse replikatsiooni protsessi ja takistama viiruse levikut.

RNA viirused peetakse tihtipeale kõige suuremaks ohuks ülemaailmse pandeemia käivitamiseks. Tõhusate ja kättesaadavate vaktsiinide või ravimite puudumisel avaldavad RNA viiruste, nagu Ebola viirus, Zika viirus ja SARS koronaviirus põhjustatud haigused märkimisväärset mõju tervisele, samas kui sealihast ründavad viirused põhjustavad seakasvatustööstusele suuri kaotusi. Samal ajal on nende kiire arengu tõttu jätkuvalt tekkinud uued RNA-viirused.

RNA viirused on nn, sest nad kasutavad DNA-d selle asemel, et esindada geneetilist koodi. Nende genoom kodeerib valke ja suhtleb peremeesrakkude mehhanismiga. Kuid siiani oli viiruslike RNA genoomide struktuur peremeesraku sees suuresti teadmata.

Cambridge'i ülikooli teadlased on välja töötanud uue meetodi Zika viiruse genoomi struktuuri ja interaktsioonide määramiseks inimese rakkudes. Seda tehnikat nimetatakse COMRADES (Crosslink of Matched RNAs ja Deep Sequencing) ja mis kõige tähtsam, seda saab rakendada mistahes peremeesraku mis tahes RNA viiruse suhtes. COMRADESist saadud üksikasjalik teave annab võimaluse kavandada uut põlvkonda ravimeid, mis töötavad, blokeerides viiruse-peremehe RNA vastasmõju või häirides viiruse genoomi olulisi struktuure.

Meie rakud sisaldavad ka RNA-d, olgu need siis valkude kodeerivad "messenger RNA-d" või "mittekodeerivad RNA-d", mis reguleerivad rakkude funktsiooni erinevaid aspekte. RNA viiruste nakkustsükkel toimub peamiselt rakkude tsütoplasmas, kus elavad paljud meie RNAd. Viiruse ja peremehe-RNA molekulid saavad omavahel suhelda otseselt "aluse sidumisega" nende struktuuri osade kaupa, teisisõnu, muutes sidemete seeriad kahe molekuli kokkuhoidmiseks. Need vastastikmõjud pakuvad viirusevastaste ravimite potentsiaalseid sihtmärke ja tõepoolest on C-hepatiidi viiruse vastane ravim, mis seob sellist peremehe-viiruse RNA koostoimet, Miraversen, täiustatud kliinilistes uuringutes.

Kuid looduslikult esineva peremehe-viiruse RNA aluse sidumise levimus ei ole teada ning uued interaktsioonid avastused on haruldased. UMC COMRADES-meetod, mille on välja töötanud Wellcome Trust / Cancer Research UK Gurdoni Instituudis dr Omer Ziv ja rahvusvaheline kolleegide kolleegium, saavad kuvada host-viiruse RNA aluse paaristamise ja avaldada RNA interakteeruvad järjestused ühes katses.

Dr Ziv ja tema kaasautorid on rakendanud meetodit COMRADES Zika viiruse genoomi uurimiseks inimese rakkudes, paljastavad selle struktuuri, samuti mitmesuguseid koostoimeid inimese regulatiivsete mitteseotud RNA-dega, näiteks mikro-RNA-dega, RNA-de ülekandega ja väikeste tuuma-RNA-dega. Uue tehnika abil selgitatakse nii aluspaari identiteeti kui ka positsiooni, pakkudes vajalikku ja piisavat infot komplementaarsete järjestuste kujundamiseks, mis võivad interakteeruda ja blokeerida iga interaktsiooni, potentsiaalsete kliiniliste mõjudega. Seega võimaldab COMRADES meetod uut põlvkonda RNA-põhiste viirusevastaste ravimite väljatöötamiseks paljudele RNA viirustele mis tahes peremeesrakus.

Professor Eric Miska laboril Gurdoni Instituudi professor Dr Ziv ütles: "COMRADES-tehnika abil saab uurida üksikasjalikke molekulaarseid vastasmõjusid viiruse ja peremeesraku RNA vahel. See võimaldab meil kujundada lühikese RNA või DNA järjestused, mida saab mida manustatakse nende interaktsioonide sekkumiseks, mis võib potentsiaalselt takistada viiruse võimet replitseerida ja nakatada täiendavaid rakke. COMRADESist saadav teave avab ukse täiesti uue viisi vastu võitlemiseks. Arvestades selle meetodi laialdast rakendatavust mistahes RNA viirusega ja mis tahes peremeesrakk, nii inimese kui ka loomse RNA viirushaigused võivad olla sellise uurimuse sihtmärk. "

menu
menu