Kaks sõltumatut uuringut toovad kaasa CRISPR-Cas12a inhibiitorite avastamise

The price of shame | Monica Lewinsky (Aprill 2019).

Anonim

Kaks teineteisest sõltumatut meeskonda on tuvastanud mitu CRISPR-Cas12a inhibiitorit. Esimene meeskond koosnes California Ülikooli liikmetest Berkeleyst, teine ​​oli Massachusettsi üldhaigla ja California ülikooli liikmetel. Mõlemad kasutasid bioinformaatika vahendeid bakteriaalsete genoomide skannimiseks võimalike inhibiitorite jaoks ja mõlemad on avaldanud oma tulemused ajakirjas Science.

CRISPR on geeni modifitseerimise meetod, mis võimaldab identifitseerida DNA segmente ja eemaldada need genoomi. Seda saab kasutada ka lõigatud lõikude asendamiseks. Oma ülesannete täitmiseks kasutab CRISPR valgu nukleaasi, mis on juhend või mall, mis kirjeldab, millised geenid tuleb lõigata ja / või asendada. Sellel meetodil sageli seostatud Cas9, mida sageli kasutati paljudes varajastes uuringutes. Kuid selleks, et Cas9 saaks korralikult töötada, tuli teadlastel ka Cas9 inhibiitorisse lisada - selle ülesanne oli vältida võõrkeha lõikamist. Hiljem on teadlased kasutanud Cas12a, kuna see pakub muid soovitud omadusi, mida Casal ei leitud. Kuid seni pole Cas12a jaoks teadaolevaid inhibiitoreid, mis takistas selle kasutamist teadustöös. Nendes kahes uues jõupingutuses on mõlemad meeskonnad leidnud, et mitmed inhibiitorid, mida nad väidavad, sobivad CRISPR-iga kasutamiseks.

Mõlemad meeskonnad kasutasid Casin2 inhibiitorite otsimisel bioinformaatika torujuhtme lähenemist - see on süsteem bakteriaalsete genoomide otsimiseks, mis hõlmab otsimist geneetiliste fragmentide jaoks, mis on tavaliselt bakterite surmavad, kuid ei ole seotud inhibiitorite bakteritega. Selle lähenemisviisi põhjal leidsid esimesed meeskonnad, et kolm inhibiitorit, kaasa arvatud üks, mis seisnes välja kutsus AcrVA1. Testimine inimese rakkudega näitas, et CRISPR-iga võib kasutada kõiki kolme. Samasugust lähenemisviisi kasutades leidis teine ​​meeskond mitu kandidaati, kes tegutses ka lootuses, kui seda katsetati inimese rakkudega. Teine meeskond leidis ka, et AcrVA1 on eriti tõhus.

Kokkuvõttes on kahe meeskonna töö andnud mitmeid võimalikke Cas12a inhibiitoreid, millest üks näib olevat eriti paljutõotav. See võib viia CRISPR-Cas12a kui uue geeni redigeerimise tööriista abil viljakatamini.

menu
menu